从小虹鳟鱼急性热疗抗性的遗传结构，及与生产性状的遗传相关性

量化。

滑借助于的时两者错综复杂取决在SNP也就是说三处的个体型

我们根据个体在扫描到的QTL的也就是说SNP三处的个体型，量化了个体的急性刺疗乙型肝炎基因型。常用Anova Tukey检探测化了两种纯合子个体型在坝体和日两者错综复杂缺点探测仪器后的TLE关联的意涵。Te关联以基因型均值的%指借助于。在每个SNP西坡三处定量Te显性效应，作为杂合个体型的最少TLE与两个纯合个体型的平方差之两者错综复杂的关联，常用单结果显示t扫描，p值反之亦然为0.05。

虹鳟鱼为等个体系由中的已断定的QTL的证明

在在此之之前的实验中的，我们探测了185 dpf和157dpf和15个月初)的6个等个体系由的急性刺乙型肝炎基因型，常用了与本深入研究中的常用的方案。等个体系由是一种稳固的实验免疫学资流，因为在每个等个体系由中的，鱼为分享基本相同的个体型，而有所不同的个体系由代表了INRAE合成社就会阶层的基因型结果显示。

在185和457 dpf时，最具施用的等个体系由为A32h，最尖锐的为A22h 。因此，在本文中的，我们将A32h为施用等个体系由，而A22h为尖锐等个体系由。如Lagarde等人[16]透过了基因型量化，其施用位列或位列在185-457dpf之两者错综复杂起因推移，因此这里不回避。

等个体系由A32h和A22h杂合系由，因为他们是由成年人的独特的纯合等个体系由B57与异性恋纯合等个体系由A32和A22，因此他们分享基本相同的母亲免疫学文化背景但有有所不同的父系由免疫学开创性。这两个性状由在此之之前透过了测序，以构建变异的目录。

在本文中的，由于B57生命体个体序列是基本相同的，我们认为只有A22和A32继父个体序列，我们检查的一些个体单核苷酸与急性刺阻力扫描在商业化人群与分享的等个体直通。

在本深入研究中的注意到的与TLE密切具体的snp中的，即较强logBF>6，我们找到了A22和A32个体分组中的假定的snp。对于较强logBF>6的SNP，我们扫描了施用A32h等个体系由是否载有不利于的等位个体，正如在商业化社就会阶层的GWAS中的估算的那样。

对所记录的基因型透过比如说统计

在本深入研究中的，对来自同一家族的两批同类型雌性虹鳟鱼为透过急性耐刺性275-285dpf或生产厂个体600-604dpf透过基因型量化。所记录的基因型的比如说统计文档。

B1批的最少BW1为85.6±12.0 g。所有基因型分组的最少rTLE均为412±56 min，但rTLE的分组两者错综复杂关联非常大和rTLE的均值。鱼为在基因型分组G1迅速滑借助于，最少319 min和小SD±14分钟，在G2，G3，G4，G5，G6说明了中的两者错综复杂和类似rTLE仅仅和SD，和鱼为G7滑借助于的最少rTLE474 min和大SD±62分钟。

平衡严重损失的Te动力学如图3所示。为了纠正这些分组两者错综复杂的关联，rTLE以0为中的心，并在每个基因型日内缩放为均值1，以得到探测仪器的基因型TLE。各分组两者错综复杂TLE的最小值和也就是说分别为−值4.5和2.7。

从鱼为到达基因型应用软件到各分组透过基因型量化的绵羊天总总共，从G1的2天到G7的12天。绵羊天总总共和6h时攻毒素盒内的低温与rTLE的平方差和均值密切具体。各基因型分组的适于天总总共与各分组内rTLE的方差和均值的表征分别为0.97和0.89。

下一场开始6小时后，下一场盒低温与TLE分组方差和SD有较强的表征，具体连由总总共分别为0.94，−为0.94。Te的适于天和低温下一场坦克6小时后的下一场也低度具体的表征−0.93：基因型分组最多的适于天也是那些低温下一场坦克在6小时是最较差的。

在精确的时两者错综复杂点测定了Te NH+ 4浓度和pH。Te NH+ 4浓度较差于比色扫描反之亦然开始每个下一场分组pH 7.4，而它范围内从0.25到1.5 mg/L三分组pH 7.2±0.3,3 h后的下一场，从2到3 mg/L三分组pH 7.2±0.4,6小时后的下一场。在攻毒素开始时和3小时后，探测了之前两分组症状的Te二氧化碳浓度。

基因型分组为从G1到G7的7个急性刺疗乙型肝炎基因型分组；rTLE平方差，对急性刺疗更为早乙型肝炎平方差（最小单位）；rTLE SD，对急性刺疗更为早乙型肝炎的准则偏差；N，鱼为基因型、个体见下文和相应总总共。逗号之两者错综复杂，鱼为基因型的总总共量。

TLE的免疫学表达式和生产厂个体

基于代代由或个体分组文档的免疫学力和免疫学表征的估算对所有个体计算借助于来了相当相同的结果。Te GBLUP估算总总共的SE较差于BLUP估算总总共和。因此，除非说明说明，在本文的其余部分中的，说明了和发表意见的结果是来自GBLUP总总共学方法的结果。

Te BLUP和GBLUP总总共学方法对所有个体透过了随机和不随机坝体缺点的扫描。除此以外随机坝体与众不同缓解Akaike文档准则的金色和GBLUP总总共学方法技巧，而不是其他相同性，因此这个与众不同只始终保持在总总共学方法技巧。

生命体关联可阐释BLUP中的±基因型变异的7.0±3.0%，在GBLUP总总共学方法中的为6.0±3.0%。TLE的免疫学免疫学总总共万人和个体分组免疫学力估算与i.e.0.24±0.07和0.29±0.05相同。TLE和G7的两分组，G1和G7对TLE免疫学力的估算不良影响有限，去掉G1和G7文档时，基于代代由和个体分组免疫学力的估算分别为0.31±0.05和0.28±0.05。

因此，G1和G7的文档被保假定文档集中的。BW1、BW2和FL的免疫学力估算为中的等，脂肪%的免疫学力极低。

急性刺疗HIV的同类型个体分组关联深入研究

常用HD个体型对TLE透过GWAS扫描。用logBF≥6扫描到7个也就是说SNP，这些QTL设在fve等位基因上。其中的，在30号等位基因上扫描到的QTL被丢弃其他SNP在也就是说SNP周围的200 kb的滑动窗口中的有一个logBF≥3。

对个体见下文簇的掩蔽检查声称，该SNP的个体见下文质量偏低，低logBF值应被认为是人为因素。因此，我们只回避了另外6个QTL，它们分别被称为TLE2-1、TLE13-1、TLE13-2、TLE13-3、TLE14-1和TLE17-1。

TLE13-1的Te西坡SNP说明了借助于QTL的有力证据，其logBF大于10。Te同类型QTL TLE13-1阐释了4%以上的TLE的基因型。其他QTL各能阐释了不到1%的基因型。这声称，抵御急性刺疗是一种低度多个体的相同性。

QTL的说服力区两者错综复杂的Te形状范围内为0.12~1.07Mb。89个有所不同的个体在6个QTL周边中的被识别系统借助于来。每个QTL周边注释的个体总总共量见表4。我们对每个QTL周边内的个体透过了文献检索，以确定那些先之前注意到的与急性低温HIV具体的个体。在QTL 13-1、13-2和13-3中的注意到了与急性刺疗HIV具体的有意涵的候选个体，并将进一步发表意见。

发表意见

在一个9个月初龄的法国商业化繁殖地虹鳟鱼为中的对急性刺疗的抵御力。我们估算了该个体的免疫学表达式及其在收获体重、叉长、胴体生产量和分枝脂肪总总共万人)时与生产厂个体的表征。我们还断定了QTL对急性刺疗的HIV，并找到机制候选个体。

抑制作用急性刺疗抵御

在急性非典型下，沾染于非典型流窄而倾向，而在慢性非典型下，沾染过强，并随着时两者错综复杂的演进减法。然而，这种攻击能力是与句子具体的。例如，在虹鳟鱼为中的，Perry等在一天的下一场中的急性耐刺被看做耐刺，而Chen等在一周的下一场中的。

无论是急性还是慢性，对非典型流的底物涉及有所不同的生理机制。虽然急性和慢性抵御低温之两者错综复杂的表征很少被深入研究，一味，在虹鳟鱼为和大西洋鳗鱼为，没有注意到关连由抵御急性刺疗，探测低温滑借助于在一天内，和抵御慢性刺疗，以增长或生假定低温下在一个多月初。

据我们为人所知，目之前还没有深入研究声称在有所不同的沾染水平和风力下的急性抵御和刺疗非典型之两者错综复杂的关连由，例如一天刺疗下一场和两天刺疗下一场之两者错综复杂的关连由。Tus是急性刺乙型肝炎基因型的更为低相同性，都有是其与半慢性和慢性刺乙型肝炎的免疫学和基因型表征，将是相当令人吃惊的，因为这些非典型前提条件也可能起因在鱼为大农场，但这超借助于了当之前的深入研究范围内。

在下面的发表意见部分中的，我们认为只有当鱼为在一天内滑借助于时，刺疗非典型才是急性的，否则则是半慢性或慢性的。

结论

这项工作利用一种较强665K SNPs的另行型低密度个体见下文感测器，为虹鳟鱼为幼鱼为急性刺疗施用的免疫学构件获取了另行哲学思想。幼期急性刺低温的免疫学力中的等，与收获期的主要生产厂个体的免疫学表征估算接上近于零。在考虑程序中的转为抗急性刺疗的优点将使在不降较差生产厂安全性的意味著得到强健的食肉动物带入可能。然而，这无论如何通过确保幼年期和收获期的TLE之两者错综复杂的免疫学表征来低。

我们的深入研究声称，虹鳟鱼为的急性刺疗HIV是多个体的，这与其他鱼为亚种的观察结果一致。事实上，这6个被确定的QTL只阐释了左右5%的基因型。

设在13号等位基因上的最非常大的QTL阐释了4%的基因型，而与急性刺疗乙型肝炎从外部上具体的个体设在该QTL的也就是说SNP周围。Te断定的QTL还具体联与复合物伴侣、氧化非典型底物、数学模型维持和细胞活过具体的个体，因此是进一步机制证明的良好候选个体。作为对扫描到的QTL的先期证明，我们深入研究了两个等个体系由的个体型对比对急性刺疗的抵御力。Te施用等个体系由在6个QTL的两个周边载有不利于的等位个体，这声称这些QTL可能在有所不同的社就会阶层之两者错综复杂分享。

尽管假定急性刺疗HIV的多个体构件，但QTL在SNP西坡三处的纯合子之两者错综复杂的最少TLE关联较大，这声称标识除此以外考虑较强很大的潜力。这些结果声称，抑制作用育种对减较差鱼为急性刺疗施用较强表征。。

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